Родился в семье бедного каменотёса корнского происхождения в Плимуте. Из-за бедности семьи практически не получил образования и большую часть детства провёл в рабочем доме. После падения в 12 лет с крыши дома на голову полностью лишился слуха. Много читал уже в детстве.

Зная о его начитанности уже в раннем возрасте его друзья вдохновляли его писать небольшие заметки в местные газеты и устроили помощником библиотекаря в местую библиотеку. Один из его покровителей, дантист Энтони Норрис Гроувз взял его себе помощником. Энтони всегда был набожен и даже изучал теологию в Тринити-Колледже в Дублине (представьте себе, бывает и такое - зубодёр-теолог). После случая с кражей денег на поездку в Ирландию, который Энтони принял за перст провидения, он делает резкий поворот в своей жизни и отправляется миссионером в Багдад в 1829 году. Один из сопровождающих его был Джон Китто.

На Востоке Китто замечает многое, что проясняет для него тёмные и непонятные эпизоды Библии - в дальнейшем множество его наблюдений станет базой сначала для описаний его путешествий в журнал Penny Magazine (имевший только около миллиона читателей в Британии и переводившийся на несколько европейских языков), а затем и для его энциклопедических работ.

Один из самых важных и заметных "защитников Библии" XIX столетия.